TCGA简易下载工具下载下来的CNV文件的sample名称该如何解读?


TCGA简易下载工具下载下来的CNV文件的sample名称该如何解读?

我需要根据CNV的分析结果做survival分析,因为不知道sample名称是什么ID类型,该如何解读,所以没办法进行ID转换,将sampleID转换为TCGA的barcode。


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因为所有的sample名称中都有“_p_”(不知道表示什么)和“_GenomeWideSNP_6_”(如果没理解错的话这个表示的是数据来源的芯片平台)。

所以尝试通过分解sample名称寻找规律,试图找到把sample转化为barcode的方法,但貌似行不通。。。

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

使用V8版本,看这里:

https://www.shengxin.ren/article/95

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