简易TCGA下载工具V8版升级简要说明

简易TCGA不知不觉已经更新到了第八个版本,之所以更新无非是有很多同志们遇到了各种各样的需求

简易TCGA不知不觉已经更新到了第八个版本,之所以更新无非是有很多同志们遇到了各种各样的需求

图中是V1-V6各个版本的细节修正问题,到了V6版本基本上已经较为完善

attachments-2017-06-ElsGFKNW593bcf7adf17V7:版本主要更新的是功能,去除了Clinical功能,换成了ClearMeth,因为甲基化数据中包含了很多重复的信息,然后占空间很大,使用此功能能够将这些文件缩小,最后合并文件时对内存需求就小了,另外增加了自动识别lncRNA的功能,在ENSG_ID转换时能够同时将lncRNA表达谱提取出来

V8:首要解决了下载cnv数据后无法对应到样本中,这个版本在fileID.tmp文件第三列统一存储了样本名称,以此来对应各个数据文件的样本问题,同时优化了合并文件时的内存消耗以及断线重连时由于fileID.tmp文件的不合法问题

另外:V6之后(不包含V6)的版本已经不支持32位系统了

使用教程还是在这里:https://www.shengxin.ren/article/1

V6版本下载链接:http://pan.baidu.com/s/1pLPpa2J

V8版本下载链接:http://pan.baidu.com/s/1dELp7rF

  • 发表于 2017-06-10 19:03
  • 阅读 ( 8670 )
  • 分类:软件工具

23 条评论

请先 登录 后评论
不写代码的码农
祝让飞

生物信息工程师

62 篇文章

作家榜 »

  1. 刘永鑫 64 文章
  2. 祝让飞 62 文章
  3. SXR 44 文章
  4. 张海伦 31 文章
  5. 爽儿 25 文章
  6. 调研图 14 文章
  7. 生信菜鸟团 13 文章
  8. deepxin 12 文章