张海伦
张海伦 - 生物信息分析员

性别: 北京 - 北京市 注册于 2017-03-24

生物信息专业毕业,专注生物信息行业,对基因组学,转录组学有所涉猎,欢迎大家相互学习。

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50 个回答

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TCGA简易工具下载数据视频教学版 能再发一次么

视频之前上传到了腾讯视频 生信人TCGA数据下载工具

回答于 2017-12-11 19:05

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如何调整此平台发布文章中图片的布局

选中图片,下方会有一个显示图片比例的按钮

回答于 2017-12-08 08:58

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请问大神有没有limma包对txt文件筛选差异基因的代码,不胜感激!

生信人小工具就可以。

回答于 2017-12-08 08:58

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GEO芯片数据转换器

小工具统一归笼到了工具盒中了,请看这里:https://www.shengxin.ren/article/222

回答于 2017-11-09 16:33

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GEO芯片转换器

http://gap.shengxin.ren/tool/8/#

回答于 2017-11-09 16:33

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用DECentre老是闪退,导入矩阵数据后就出现程序停止运行

数据截图,发下,看看。

回答于 2017-11-07 14:42

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用批量生存分析工具做生存分析

这个可能是因为数据量有点大。你是不是可以先做差异,把差异的基因筛选出来,再去做生存分析呢。

回答于 2017-11-03 12:51

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GEO中GPL2507平台,没有genesymbol和ID信息,这样的怎么处理可以...

GPL2507平台样本信息 IDtarget IDSequenceSourceSource of the target sequence accessionGB_ACCRefSeq identifierAnnotation DateDate of build of sequence source (for UniGene and Gnomon)SPOT_IDUniGene, Gnomon and control sequences 确实没有提供gene symbol 但是提供的GB_ACC 。和SPOT_ID 建议,先利用这两个id...

回答于 2017-10-30 14:32

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请问:您有统计基因组序列信息的脚本吗?比如得到它的n50, gc...

你好,首先感谢邀请。 这个处理基因组序列的脚本,是perl R还是python 呢。 这个N50 GC含量还是挺好做的。GC含量生信人的小工具就可以做。 这个覆盖度,就得需要通过read和基因组去比对获取吧。 这个脚本就麻烦了。 如果有定制化需求,可以找我,定制化开发。 祝好。

回答于 2017-10-27 15:01

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换了个数据下载,也更改了导出路径,还是不行,一直报错。

错误中提示,无法切换目录。建议改成英文路径测试下。

回答于 2017-10-25 09:35