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cafe计算基因家族收缩和扩张,最终的结果应该如何看,如何直接生...

这个结果怎么看,还是挺麻烦的,建议你看看cafe 的官方说明手册。这个树的绘制可以利用mege等软件绘制图片,然后再利用ai添加。 我自己开发过一个软件包,是基于一个R包ape开发的。如果你有编程基础,你也可以试下。

回答于 2017-04-11 15:53

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R语言中有哪些包可以处理批次效应

这个问题其实在10年有过一篇文章讲过这个事情,从统计学上说就是如何平衡组内和组间的效应。R语言中的sva包是可以之间处理的。除此之外,推荐给大家一个在线网站。http://www.itl.nist.gov/div898/handbook/eda/section4/eda42a3.htm。 1.4.2.10.3.Analysis of the Batch EffectBatch is a Nuisance FactorThe two nuisanc...

回答于 2017-03-30 11:32

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R包如何批量转移升级安装

1、先使用R的installed.packages()函数导出所有的已安装的包名 2、把包名存放到文件当中 3、在新安装的R中读取这个文件获得包名 4、再使用installed.packages()函数调出已安装的包名 5、然后使用setdiff比较取得尚未安装的包名 6、使用installed.packages()或者bioconductor安装即可,参数可为向量

回答于 2017-03-26 15:39