R语言基础绘图——韦恩图
1、软件介绍 MUSCLE(Multiple Protein Sequence Alignment)是一款蛋白质水平多序列比对的软件,在速度和精度上都优于 ClustalW。在进行多序列比对的时候,大多数情况下可以优先使用 MUSCLE。有...
细胞自噬是指在自噬相关基因的调控下,利用溶酶体降解自身受损的细胞器及大分子物质的过程,以此维持细胞自身的需要及细胞器的更新。 一、细胞自噬的基本概念及特征 1、自噬的过程
事实上很多时候都需要做基因ID的转换,与其依托于别人的工具不如自己动手,由于研究发表的滞后性,往往很多工具提供的转换并不是最新的,理解转换原理才能让你来去自如
相关表和相关图可反映两个变量之间的相互关系及其相关方向,但无法确切地表明两个变量之间相关的程度。 相关系数是用以反映变量之间相关关系密切程度的统计指标。相关系数是按积差方法计算,同样以两变量与各自平均值的离差为基础,通过两个离差相乘来反映两变量之间相关程度;着重研究线性的单相关系数。
R语言基础绘图——散点图
本工具专门用来绘制火山图,可以自由定制颜色,横轴纵轴的最大最小值,导出发表级的图片。 软件输入只需两列,一列为foldchang(有没有做log2转换即可),一列为p值(有没有log皆可) 软件界...
reset
简易数据标准化工具
作者:严涛 浙江大学作物遗传育种在读研究生(生物信息学方向)伪码农,R语言爱好者,爱开源 编者按:数据可视化是解析、理解和展示数据不可缺少的一部分。炫或不炫看个人喜好和功
R语言添加p-value和显著性标记,原文链接 https://mp.weixin.qq.com/s/gRw0krS3LY7c0QK9y47EJw 作者简介 Introduction taoyan:伪码农,R语言爱好者,爱开源。 个人博客: https://ytlogos.gi...
主成分分析法是数据挖掘中常用的一种降维算法,是Pearson在1901年提出的,再后来由hotelling在1933年加以发展提出的一种多变量的统计方法,其最主要的用途在于“降维”,通过析取主成分显出的最大的个别差异,也可以用来削减回归分析和聚类分析中变量的数目,与因子分析类似。
事实上很多院校对SR、OT都嗤之以鼻,但是今年oncotarget竟然逆势上涨,小编又不小心关注了一下,刚好看到一篇比较简单适合新手入手的文章,今天就来聊一聊这篇不做实验依然发五分以上文章的套路。 这篇文章是去年十月份发表在oncotarget上的题目是:A seven-gene signature predicts overall survival of patients with colorectal cancer
这么优秀的热图,只需要10秒,你信吗?
如何从UCSC下载refseq参考基因注释文件
本文由【计算表观遗传学】公众号首发,针对表观遗传领域中研究最为广泛的DNA甲基化修饰及其广泛应用的群体研究中甲基化水平检查芯片技术进行系列讲解,帮助初学者了解芯片甲基化数据的获取、处理及深入分析的流程。感兴趣者可在公众号和社区中留言交流。
不是所有培训都能值回票价的,更不是所有培训都赠送价值几千元的线上视频课程!!
《柳叶刀》旗下杂志,居然也收生信分析文章..
今天是十五元宵节,即是和家人团聚的机会,也是赏月的好日子。 但作为科研汪的我,在狗年应更加努力,争取在狗年旺旺,从加班狗中脱颖而出。 分享一个相关分析可视化实战,祝大家元宵节快乐...
GFF3格式说明备忘