热门的文章 - 第16页

mongodb内存占用过高可行的限制办法

最近服务器卡的要死，后来发现是用来MongoDB在后台建索引，占了一半的内存，MongoDB本身是一个极耗内存的数据库，你有多少内存他都能吃进去，谷歌之后寻到解决办法如下：服务器系统是CentOS7...

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祝让飞
发布于 2018-12-27 08:40
阅读 ( 6080 )

细菌完成图组装软件简单介绍

细菌基因组简单组装

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SXR
发布于 2017-04-01 16:45
阅读 ( 6071 )

What？PC跑转录组。

What？PC跑转录组。简介上次小编介绍了如何利用生信人小工具进行芯片数据的处理。但是相信大家有些时候还是需要从转录组数据开始的。应用场景：比如之前的数据大家只是对编码的基因进...

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张海伦
发布于 2017-10-23 17:09
阅读 ( 6069 )

16S预测细菌组表型-bugbase：革兰氏阴阳、生物膜、致病力、移动元件、氧气消耗等

基于16S OTU表预测细菌表型数据库，同时可进行组间差异分析 BugBase Predicts Organism Level Microbiome Phenotypes Tonya Ward, Jake Larson, Jeremy Meulemans, Ben Hillmann, Joshua Lynch...

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刘永鑫
发布于 2017-12-15 08:31
阅读 ( 6039 )

芦笋基因组揭示了Y染色体的起源和进化

背景有花植物中，雌雄异株的植物仅占6%，涵盖约200个科60个属的14600个物种。所有雌雄异株植物有可能进化出性染色体，其中簸箕柳和芦笋等植物的同型性染色体处于进化早期。通常认为植物性染...

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张海伦
发布于 2017-11-06 20:49
阅读 ( 6039 )

Genewise预测假基因的注意事项

1、genewise简介 Genewise软件是大家在基因组项目中经常用到的软件，可能主要用也基因预测和假基因预测。基因预测以往的文章都提及过，对于假基因预测这部分，也说过，但是总觉得有一些注...

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SXR
发布于 2017-03-30 21:36
阅读 ( 5985 )

Nature：如何做一篇肠道菌群免疫的顶级文章

本文转载自“科研小榴莲”，己获授权。今天小榴莲和大家一起探讨一篇17年十一月份发表在Nature的文章。在西方以及中国部分地区高盐饮食是一种非常普遍的现象，高盐饮食已经成为高血压以及心...

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刘永鑫
发布于 2018-01-23 19:53
阅读 ( 5982 )

SesameFG：芝麻功能基因组学的综合数据库

SesameFG为芝麻功能基因组学研究和分子育种提供了宝贵的资源和工具

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调研图
发布于 2017-11-06 21:05
阅读 ( 5964 )

R堆叠柱状图各成分连线画法：突出展示组间物种丰度变化

作者：朱微金李陈浩堆叠柱状图连线画法提出问题 18年1月29日宏基因组转载了中科院生态中心邓晔组的文章《土壤细菌定量方法结合相对丰度分析揭示种群的真实变化》。其中的图3基于堆叠柱状图...

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刘永鑫
发布于 2018-02-01 18:37
阅读 ( 5958 )

用公共数据发文章-基因家族分析好思路

利用公共数据发文章，基因家族好思路。虽然我们一直在说可以“用别人的数据，写自己的文章”，但是具体怎么操作，很多同学还是不清楚。今天就用一个完全用公共数据库资源进行分析发文的例子来和大家分享下这方面的思路。

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组学生物
发布于 2018-07-13 10:01
阅读 ( 5954 )

社区会员开通步骤

想要成为生信分析达人么？想要了解社区视频的秘密么？

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生信分析流
发布于 2018-09-07 16:15
阅读 ( 5886 )

R来完成表达芯片分析全流程-有笔记有视频

需要学R语言，一站式学会表达芯片处理

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生信菜鸟团
发布于 2017-08-10 22:50
阅读 ( 5884 )

如何做一个发表级的单基因在泛癌中的表达差异分析

众所周知，现阶段研究肿瘤基本离不开TCGA,研究单个基因的话更离不开单个基因在泛癌中的表达，这是一个万能钥匙，因为如果这个基因只在你研究的肿瘤中差异表达的话说明了特异性，如果他在大多数...

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admin
发布于 2021-07-04 15:37
阅读 ( 5874 )

Cell：人体细菌到究竟有多少，再作报告必引此文

关于人体细菌与人体细胞的比例，有众多文章和学术报告反复引用1972年关于细菌数量是人体细胞10倍的结论来突出细菌的重要性。然而这一46年前的粗糙结论显然不符合最新研究的结果。以色列魏茨...

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刘永鑫
发布于 2018-02-25 17:31
阅读 ( 5853 )

社区打赏功能使用教程

众人拾柴火焰高，为了鼓励广大生信爱好者分享知识，社区最新系统中增加了打赏功能以资鼓励生信人分享有用的知识。打赏功能设置如下：首先在账号设置（https://www.shengxin.ren/profile/bas...

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admin
发布于 2017-10-12 09:27
阅读 ( 5768 )

用TCGA数据不用编程轻轻松松构建CeRNA网络

TCGA数据据是由美国国家癌症研究所（NCI）及国家人类基因组研究所（NHGRI）联合建立，其包含丰富的肿瘤数据类；ceRNA其主要基于竞争性内源RNA假说解释mRNA、假基因、长链非编码RNA之间如何通过miRNA反应元件进行“对话”。

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调研图
发布于 2018-11-23 18:02
阅读 ( 5749 )

肿瘤研究不能不知道的TCGA数据库挖掘工具大全，TCGA再也不愁！

TCGA数据库的挖掘工具层出不穷，从数据下载到数据挖掘，这里小编给大家整理一份官网的数据挖掘工具大全： http://www.cancerimagingarchive.net/ The Cancer Imaging Archive (TCIA) TCIA存储...

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余繁荣
发布于 2019-03-21 12:36
阅读 ( 5742 )

多种生信套路组合——发4分的文章

这篇文章今年1月份发表在J Cell Mol Med上；文章只有两套数据，一套训练集和一套验证集；作者构建的模型AUC也不是很高，但是文章的分数发了4.6分。主要原因是作者能够将很多常规分析串起来，这些分析大家在泛癌课程和之前分享的文章、小工具推文中大家都接触过。所以小编提议大家多看文章，英文看不懂，没有关系，可以先看小编的解读，再看看原文，锻炼自己的思维。