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UCSCXenaTools包用法介绍——搜索与下载TCGA、GDC、ICGC等公开数据库数据集

...UCSC Xena接口,可以获取一些UCSC Xena存储的信息,包括GDC、TCGA、ICGC、GTEx、CCLE等数据库的上千个数据集。特别是TCGA(hg19版本)的一部分数据UCSC做了非常好的标准化处理,下载即可用。这几天我想要能够通过代码下载相关数据,...

简易TCGA下载工具 能否下载TCGA里面control数据

简易TCGA下载工具  能否下载TCGA里面control数据?

简易TCGA下载工具 能否下载TCGA里面control数据

简易TCGA下载工具 能否下载TCGA里面control数据?

解决 TCGA简易下载功能 本地无法连接TCGA

今天2018-10-27新安装的v14版本的 TCGA下载工具,无法连接TCGA数据库,请问怎么办? 补充:我使用sangerbox中生信人V-p-N。是不是需要自己购买其他的科学上网工具才行?

TCGA简易下载工具 缺少TCGA-COAD数据集

TCGA简易下载工具 缺少TCGA-COAD数据集

TCGA现有数据汇总

...理过的东西也发一发。截止2018年GDC的最新一次更新后,TCGA现存数据大致如下:CNVFPKM/FPKM-UQmiRNA isoformclinical甲基化450KAcute Myeloid Leukemia(TARGET-AML)急性髓系白血病285151105200140Acute Myeloid Leukemia(TCGA-LAML)急性髓系白血...

TCGA=matrix(as.numeric(as.matrix(GeneExp)),nrow=nrow(GeneExp),dimnames=list(rownames(GeneExp),colnames(GeneExp))) > TCGA=averegs(TCGA) Error in averegs(TCGA) : 没有"averegs"这个函数 >

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TCGA,provisional与TCGA,pancancer atlas 与TCGA ,NATURE 2016分别代表什么,简易下载工具下载的是哪些部分

一个样本有3个数据,编号分别为TCGA-44-6775-01,TCGA-44-6775-01_Rep307,TCGA-44-6775-01_Rep376这是什么情况?

祝老师,您好!之前的问题已经解决,谢谢您的解答。再打扰您问一下,一个样本有3个数据,编号分别为TCGA-44-6775-01,TCGA-44-6775-01_Rep307,TCGA-44-6775-01_Rep376这是什么情况?

TCGA建议下载工具找不到TCGA-CESC、COAD等多个数据集,请问是什么原因呀?

TCGA建议下载工具找不到TCGA-CESC、COAD等多个数据集,请问是什么原因呀?之前使用时可以找到TCGA-CESC、TCGA-COAD,现在无法在数据集界面看到,不知道是什么原因

简易TCGA下载工具链接不到TCGA,获取远程代理也失败

就像这样,已经登陆,java和R也配置好了,谢谢大家!

TCGA简易下载工具下单HTSeq FPKM数据是 TCGA RNA-seqV2吗

TCGA简易下载工具下单HTSeq FPKM数据是  TCGA  RNA-seqV2吗 

TCGA下载工具的ENSG_ID转换和TCGA ID转换器的区别

请问简易TCGA下载工具的ENSG_ID转换和TCGA ID转换器的转换有什么区别吗?

TCGA

癌症基因组图谱(TCGA)是一个从2005年开始的一个项目,旨在使用基因组测序和生物信息学来分析负责癌症的基因突变。 TCGA应用高通量基因组分析技术,通过更好地了解这种疾病的遗传基础,提高我们诊断,治疗和预防癌症的...

祝老师您好:TCGA数据下载后ID转换后TCGA-25-2404-01, TCGA-13-0765-01类似于这样的命名,怎么样区分癌组织与癌旁组织?感谢。