请问，通过TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling（数据类型是芯片数据吗？）可以做miRNA差异表达分析吗？如果可以的话，用DECenter小工具时应选的方法是limma(芯片），还是edgR（counts数据） - 生信人

请问，通过TCGA简易工具下载的miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling（数据类型是芯片数据吗？）可以做miRNA差异表达分析吗？如果可以的话，用DECenter小工具时应选的方法是limma(芯片），还是edgR（counts数据）

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2 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师 2017-11-09 10:45

建议标准化后使用limma

nuifu - 医师 2018-10-04 23:14

miRNA-seq-BCGSC-miRNA Profiling 标准化可以rma完成吗？

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天空的眼泪提出于 2017-11-09 10:39