lncRNA的识别

大家好,这个简易下载工具着实好用,首先对开发者表示由衷感谢。

其次就是在使用的时候遇到了一些问题,在识别lncRNA的时候,软件自动将文件划分了两类,一类应该是mRNA,另一类是lncRNA的表达矩阵吧。

但是我在做二者id名交集的时候发现,经过转化id,也就是都是symbol的id,mRNA和lncRNA存在多达2000个交集,这是正常现象吗?

因为我并不是学生物的,所以想问问清楚。

lncRNA和mRNA有交集作何解释呢?

谢谢各位回答的朋友哈。

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

mRNA部分是转换的常见的基因(包括部分非编码和假基因的,大概有三千左右,实际编码蛋白的基因不到两万的样子),因为有些lncRNA其实是没有明确界定的(有可能会表达),你的这个属正常现象,如果实在介意的话可以自己再进一步去除。

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