关于批量生存工具的一些改进建议

首先生信小工具都挺好用的。最近试着使用了批量生存分析工具。发现有几个我不能解决的问题,也有可能是对软件不太了解的原因。问题如下:

1.TCGA分析时经常会卡在一个地方就没有反应了,重新关掉软件再分析又卡在另外一个地方,我看到前面有工程师回答说是内存不足,我查到自己电脑内存和CPU闲置很多,内存才用了不到30%。卡死后不能直接重新选择分析,必须重启软件。而GEO没有遇到这个问题,不知道如何解决?

2.分析出来的完成后,不能在软件中给予基因进行排序,也不能筛选感兴趣的基因;

3.是否能像其它统计软件一样,是否可以导出原始数据结果,并且在需要 时可以随时用生信小工具打开这个结果,查看KM生存结果。

4.分析完成后是否可以自由调整分类方式和比例,其统计值是否是根据调整的cutoff值动态计算的?

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1 个回答

祝让飞 - 生物信息工程师

感谢您的建议,我们正在专研优化这个过程,在六月份之前会有全新的版本

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  • Pham 提出于 2018-05-19 02:39

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