Sangerbox 3.0:一站式的科研数据分析和写作投稿平台

从第一款简易TCGA下载工具开始,SangerBox便有了傻瓜式、易操作的基因,秉承简易、高效的原则,SangerBox已经进入 第三代系统。 第一代 SangerBox为一款 桌面式的 软件,易上手,但是 在不同电...

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  • 发布于 2021-06-16 15:37
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建模的精髓:可靠性>方法

总结:这篇文章构建模型的方法非常简单,门槛不高。 建模可以有很多角度:关键基因,诊断,复发风险,耐药,转移,预后等等等等 数据可以有多种维度:mRNA miRNA lncRNA,CNV,SNP,甲基化等等等等 要把更多的篇幅放在模型鲁棒性的检验上

实战系列(三)模仿4分胃癌发病机制和预后关键基因的文章

DOI : 10.3389/fgene.2018.00265我们桑格助手的读者一定明白给 DOI是为什么,如果万一第一次看本公众号的文章,不明白,我稍稍解释一下,通过DOI可以浏览到文献的全文(我们不说下载(#^.^#)桑格助

实战系列(一)手把手复现3分lncRNA经典小文章

DOI :  10.1080/21691401.2017.1366334 17年发表的与肺鳞癌预后相关的lncRNA研究,影响因子3.026 此篇相对有点早,但是作为一个标准,如果不能完成这样的一个研究,想做近期热点的免疫研究是很难

医学博士的开题神器,了解一下?

最近有一些博士与小编讨论开题问题。 小编就会问到那你都有什么准备呢,做了哪些前期工作,得到的答案是啥也没有... 原因很复杂,但主要原因是没有足够的时间去看文献和前沿的报道,

肿瘤研究不能不知道的TCGA数据库挖掘工具大全,TCGA再也不愁!

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  • 余繁荣
  • 发布于 2019-03-21 12:36
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  • 余繁荣
  • 发布于 2019-03-21 12:36
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TCGA简介

GEO数据库及应用场景介绍

NCBI于2000年发起的基因表达汇编(GEO)计划。致力于建立一个基因表达数据仓库和在线资源,用于从任何物种或人造的来源检索基因表达数据。 GEO主要包含各种芯片数据,也有少部分测序数据,

MALAT-1简介

MALAT-1的发现2003年,Ji等从初期非小细胞肺癌患者的肿瘤细胞中筛选出数个差异表达基因,其中包括含一个与肺癌转移和预后相关的未知转录物,采用RACE法扩增到一个长约940nt的片段,经检索比对...

社区会员开通步骤

想要成为生信分析达人么?想要了解社区视频的秘密么?

TCGA现有数据汇总

今天看到一篇帖子, 193种已发表植物基因组汇总,简简单单多余的东西一概没有。唤起了我很多最初的想法和感动,见贤思齐,把我整理过的东西也发一发。 截止 2018年GDC的最新一次更新后

高质量的热图,是什么样的?

这么优秀的热图,只需要10秒,你信吗?

真正做到“零基础、零代码、高质量”生物信息学习方法,发表文章,事半功倍

由于现在网络的发达,大部分生物、医学方向的同学都已经知道生物信息学是对 提升科研效率,发文章 是极其有帮助的,然后都想学。 确实,看到这些炫酷的图真是眼馋,加上几幅,文

小编调研为什么比你快---桑格助手使用秘籍

经常在跟医生交流技术的时候,他提到一个感兴趣的基因或者调控机制,小编能很快给出一系列相关研究资料,老师觉得很神奇是不是我之前研究过,或者这个研究已经很火热了,其实并不是的

来自6分新贵杂志的生信数据分析

《柳叶刀》旗下杂志,居然也收生信分析文章..

基因表达与甲基化关联分析,挖掘表观诱导的潜在肿瘤标志物(生信分析方案)

通过基因表达与甲基化的关联分析,筛选启动子区域甲基化修饰改变而引起 基因表达改变,从而对病人预后产生不良影响的基因。

桑格助手公众号使用攻略

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  • 发布于 2018-07-03 15:12
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扩增子分析神器USEARCH简介

本文中引用统计采用Google学术,统计日期截止2017年10月9日。 Usearch简介 主页:http://www.drive5.com/usearch/ Usearch是什么?它是超快的序列分析软件,在序列比对、聚类、操作等多领域...

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  • 刘永鑫
  • 发布于 2017-10-12 23:01
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关于生信人问答平台金币产生及获取

生信人问答平台本着知识分享,互助共进的原则,提供给广大生信人分享知识,获取知识的网络平台,在本平台中采用金币作为唯一衡量知识贡献的标准,金币不提供充值,是本平台的知识的象征,他只能由知识产生,产生规则如下

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  • 发布于 2017-08-01 21:24
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