做富集分析不一定非得用R,结果依然秀色可餐
那么经过前面一系列的操作后，终于拿到我们需要的差异基因，下面就要开始这些差异基因的表演了，估计大家首先想到就是这些基因有一个什么功能，首选就是KEGG和GO富集分析，目前大家常用的是...
那么经过前面一系列的操作后，终于拿到我们需要的差异基因，下面就要开始这些差异基因的表演了，估计大家首先想到就是这些基因有一个什么功能，首选就是KEGG和GO富集分析，目前大家常用的是灰常多，在线比如DAVID、KOBAS等，R包有clusterProfiler等等，让人眼花缭乱，那么今天我们的讲师给大家主要介绍DAVID和g:Profiler。那么拿到富集结果后怎么将他展示出来呢，可以通过气泡图、柱状图、圈图等，这里我们再给大家讲解以下cytoscape中的Enrichment和ClubGO两个模块，那么一睹为快吧
1、万年不变的开场介绍
2、DAVID操作界面
通过excel对结果展示
3、g:Profiler操作过程以及讲解
4、重点来了，cytoscape使用介绍搞起来
- 发表于 2018-06-15 20:11
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