批量计算生存分析工具说明

生存分析:对一个或多个非负随机变量进行统计推断,研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科,既考虑结果又考虑生存时间的一种统计方法,并可充分利用截尾数据所提供的不完全信息,对...

生存分析:对一个或多个非负随机变量进行统计推断,研究生存现象和响应时间数据及其统计规律的一门学科,既考虑结果又考虑生存时间的一种统计方法,并可充分利用截尾数据所提供的不完全信息,对生存时间的分布特征进行描述,对影响生存时间的主要因素进行分析。

生存分析不同于其它多因素分析的主要区别点:生存分析考虑了每个观测出现某一结局的时间长短。

本工具提供了便捷的批量计算基因表达的生存分析功能,简单实用,界面如图:

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从图中可以看出,只需要四步:

step1:导入表达谱数据(第一列为基因,第二列开始为各样本的表达数据,第一行为样本名称)

step2:导入样本信息数据(第一列为样本,第二列开始为各样本的随访信息,其中包含死亡和生存时间)

step3:右侧选择死亡状态列和生存时间列,同时选择时间单位,还可以进一步筛选随访条件,比如默认(随访时间要大于1个月,生存时间截止日期十年,大于10年的默认为未死亡)

step4:批量运行即可得到每个基因的结果

然后结果展示页主要是对于一些基因的分类之后进行K-M曲线绘制,可以导出pdf和jpg两种格式的数据


  • 发表于 2017-08-16 14:30
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  • 分类:软件工具

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